Низкая цена
Всего 249a за скачивание одной диссертации
Скидки
75 диссертаций за 4900a по акции. Подробнее
О проекте

Электронная библиотека диссертаций — нашли диссертацию, посмотрели оглавление или любые страницы за 3 рубля за страницу, пополнили баланс и скачали диссертацию.

Я впервые на сайте

Отзывы о нас

Исследование структуры и динамики каналообразующего антибиотика зервамицина-IIB в мембрано-моделирующих средах методом спектроскопии ЯМР : диссертация ... кандидата физико-математических наук : 03.00.02

Год: 2005

Номер работы: 63354

Автор:

Стоимость работы: 249 e

Без учета скидки. Вы получаете файл формата pdf

Оглавление и несколько страниц
Бесплатно

Вы получаете первые страницы диссертации в формате txt

Читать онлайн
постранично
Платно

Просмотр 1 страницы = 3 руб



Оглавление диссертации:

1.1 Спектр активности и специфичность действия АП. липидных мембран в качестве мишеней для АП обуславливает Выбор одновременно как сильные, так и слабые стороны их действия: широкий снектр активности и вместе с тем низкую снецифичность. Многие АП одновременно антимикробную, фунгицидную, нротивовирусную, демонстрируют противоонухолевую, иммуномодулируюшую и цитотоксическую активности [43]. Причем, если антимикробная активность наблюдается в микромолярном диапазоне копцентрапий, то цитоток

1.4 Перспективы использования АП. В последнее время интерес к АП возрос из-за возможности их использования в терапии заболеваний, вызванных патогенными микроорганизмами, резистентными к "классическим" антибиотикам, а также из-за их противовирусных и противоопухолевых свойств. Одпи природные пептиды и их синтетические аналоги уже проходят последние • циклы клинических испытаний в качестве местных антибиотиков [27], а использование других представляется перспективным в противоопухо

2.1 Структуры пептаиболов и их классификация. В настоящее время известно более 300 пептаиболов. Последовательности всех этих пептидов вместе с имеющимися пространственными структурами высокого разрешения собраны в базе данных пептаиболов (http://w\v\v.crvst.bbk.ac.uk/peptaibon [2,4]. Аминокислотпые последовательности некоторых нентаиболов приведены в Таблице I. В природе они встречаются в виде сложных смесей родственно близких нентидов, часто отличаюшихся друг от друга заменой одной или

2.2 Биосинтез пептаиболов. Анализ смеси гомологичных пептидов, продуцируемых одним грибным штаммом, показывает, что замены, различающие эти иецтиды, ("мутации") происходят только в пекоторых положениях основной цеци и включают в себя только структурно близкие остатки. Например, аламетицин, продуцируемый Trichoderma viride, представляет собой смесь из 23 пептидов, 13 из которых - нейтральны (Alm-Rf50), а 10 - отрицательно заряжены (Alm-Ri30) [129]. Основное отличие между этими пеп

2.3.1 Биологическая активность пептаиболов. Активность против бактерий и паразитов значительную антибактериальную Все длинные пептаиболы демонстрируют активность против грамположительпых оргапизмов (MIC >

0.5 мкМ), и мепее активпы по отнощению к грамотрицательным организмам (MIC > 25 мкМ), в том числе нолностью неактивны по отнощению к Е. соИ [6,7,13,134-139]. Эти пептиды также активны против микроорганизмов класса Mollicutes (включая микоплазмы и спироплазмы) - маленьких бакте

2.3.2 Активность против грибов, роль в защите растений. • Пентаиболы не действуют на грибы семейства Candida [7,139,147], однако, эти нентиды актив1ю ингибируют рост некоторых видов нитевидных грибов и дрожжей [13,137,139]. В основном это касается фитонатогенных грибов (например, Sclerotium cepivorum, Phoma destructiva), которые длинные нецтаиболы ингибируют с MIC в дианазоне 25 - 60 мкМ [13,136,137,143]. Короткие нентиды (<16 остатков) ингибируют рост Sclerotium cepivorum с меньшей акти

2.3.3 Активность против клеток эюивотных и митохондрий Пентаиболы очень активны иротив клеток животных и млекопитающих. Длинные иентаиболы демонстрируют гемолитические свойства с ЕС50 в диапазоне от 7 мкМ до 40 мкМ, но своим свойствам занимая нромежуточное положение между меллитином (ЕС50 ~

0.3 мкМ) и детергентом SDS (ЕС50 ~ 62 мкМ) [48,135,150-153]. Короткий зервамицин (16 остатков) обладает аналогичными свойствами. Значительный лизис эритроцитов наблюдается уже при концентрации

2.3.4 Факторы, определяющие активность, связь с образование.м каналов в модельных мембранах Как следует из выше изложенного, биологическая активность пептаиболов в основном зависит от длины пептида. По отношению к грамположительным бактериям, микоплазмам, фитопатогенным грибам, эритроцитам и митохондриям активность пептаиболов падает пропорционально уменьшению этого фактора [15,136,146,165,166]. Не менее важную роль играет общая гидрофобность молекулы. Так, например, заряженные аналоги длинн

2.4.1 Пространственная структура пептаиболов. Элементы вторичной структуры, встречающиеся в пептаиболах Больщое процентное содержание (~ 40%) а,а-диалкилированных аминокислотных остатков Aib и Iva в молекулах нептаиболов определяет тип возможной пространственной структуры для этих пептидов как правоили лево-закрученную спираль. Баланс между различными типами спиралей (а-снираль, Зю-спираль) определяется как структурпыми факторами, так и окружением молекулы [173]. Направление закрутки спирал

2.06 А Роль остатка Pro и другие структурные факторы, отвечающие за активность пептаиболов Наличие одного или нескольких остатков Pro/Hyp играет важную структурную роль в молекулах пептаиболов. В водорастворимых белках пролин препятствует образованию как а-спиралей, так и Р-структур [190], но он часто встречается в ТМ спиралях мембранных белков [191]. Отсутствие у Pro NH-группы, и как следствие, невозможность выступать в качестве донора водородной связи, а также стерическое 48 паталкивапие

2.4.3 Структура и динамика длинных пептаиболов: ачаметицин, хрисоспермин и трихотоксин Кристаллические структуры аламетицина-КЙО (Alm-Ri30) и трихотоксина-А50Е (Tt-A50E) (Рис.

7) иллюстрируют вышеизложенные принципы [80,198]. Обе молекулы представляют собой а-спирали, изломанные в середине на остатке Pro''* (номера приведены для аламетицина). Участки Зю-спирали встречаются только у аламетицина на концах молекулы и в месте излома. Излом на полярной стороне спирали делает ее выпуклой и эк

2.4.4 Структура и динамика коротких пептаиболов: зервамиции, антиамебин, цефаибол, ампуллоспорин и харзианин Структура Leu-зервамиципа (Zrv-Leul) была определена в четырех различных кристаллических формах [184,214]. Во всех кристаллах N-конец пептида представляет собой а-спираль, которая закапчивается изломом на Нур'°, после которого цепь пептида имеет конформацию P-bend ribbon. С-концевая спираль включает в себя еще два иминокислотных остатка Нур'^ и Рго'^. Выпуклая сторона пептида нолярна,

Молекулы пептаиболов идеально подходят для формировапия ТМ каналов по BS механизму (Рис. 5А). Пептиды, состоящие из 20-16 остатков, представляют собой амфифильпые спирали с длиной > 2бА, что достаточно для пропикповепия через гидрофобную часть мембраны (Рис. 5А1). Более короткие пептиды могут действовать согласно одной из модифицированных BS моделей. Эти модели включают в себя либо подстройку гидрофобной толщины мембраны под длину пептида (эффект hydrophobic matching. Рис. 5А2) [122], либо

3.1.1 Начачъное связывание длинных пептаиболов с бислойными мембранами Исследование с номошью спектроскопических методов, таких как КД [234,235], ИК [153,236,237] и СР [235] показали, что длинные пентаиболы связываются с мембраной в спиральной конформации. Детальное исследование процесса связывания Alm-Rf50 [238], Alm-Ri30 [48], Нур-А [153,234] и флуоресцентно- [239] и спин-меченых производных Alm-Ri50 [114] с везикулами, составленными из PC, при номощи КД спектроскопии, спектроскопии-флуо

3.1.2 Положение спирали длинных пептаиболов относительно мембраны ЭПР и ЯМР-исследования снин-меченого по С-концу нроизводного Alm-Rf50 [114,242], а также исследование флуоресценции трихорзианинов (Tz-AIIIc, Tz-BIIIc, 19 ' Площадь отдельной спирали аламетицина, лежащей в плоскости мембраны (350 А^), гораздо больще, чем площадь сечения двух (140 А^) или трех (210 А^) молекул PC. остатков), содержащих С-концевой Тг1 [9,247], ноказало, что в мембраносвязанном состоянии С-конец длинных пептаи

3.1.3 Моделирование структуры ачаметицина в мембране обьяснение экспериментально полученным противоречивым Теоретическое данным относительно расположения спирали апаметипипа в мембране было нолучено методами молекулярного моделирования. Исследование методом молекулярной динамики (МД) структуры и положения молекулы аламетицина относительно неявно заданной мембраны (представляющей собой прямоугольный низкополярный регион с действующим на остатки пептида МНР) показало, что ТМ состояние спирал

3.1.4 Механгам перехода в ТМ состояние и наблюдение пор в мембранах Переход из поверхностносвязанного в ТМ состояние наблюдался для аламетицина в ориентированных бислойных мембранах методом ОКД. При низких значениях PB:L В мембранах наблюдались поверхностносвязанные спиральные пептиды (состояние S). А при повышении концентрации иецтида до PB:L* (DPhPC ~ 1:140, DOPC > 1:250) начинался кооперативный переход в ТМ состояние (I), который полностью заканчивался при PB:L ~ 1:20 [262]. Положение

3.1.5 Влияние состава бислойной мембраны и трансмембранного потенциала Состав бислоя влияет на положепие в мембране и конформацию аламетицина и других длинных пентаиболов, следовательно, он также должен значительно влиять на эффективность связывания и активность пептидов. Так, добавление к мембране липидов, имеюших отрицательную снонтанную кривизну и склонных к образованию обратной гексагональной фазы (Ни), например РЕ, должно противодействовать ноложительной кривизне, вносимой нептидами в S

3.2.1 Свойства каналов пептаиболов и модели их устройства. Потенциал-зависимая и потенциал-независимая проводимостъ пептаиболов в плоских .мембранах Проводимость популяции каналов пептаиболов в плоских модельных мембранах (BLM) зависит от приложенного нанряжения, концентрации пентида, концентрации соли в растворе и состава мембраиы (например, длины липидов и присутствия молекул холестерина) [64,240]. Количественное описание зависимости проводимости G = I/V от потенциала Vn концентрации пепт

3.2.2 Система уровней проводимости пептаиболов Исследование проводимости отдельных каналов для нептаиболов выявило наличие нескольких уровней проводимости. Открытые состояния канала чередуются с более длительными нериодами отсутствия тока. Длительность этих нериодов зависит от приложенного трансмембранного потенциала, а нроводимость самих уровней (нри нотенциалах < 100

мВ) потенциал-независима, т.е. нодчиняется закону Ома [276]. Число наблюдаемых уровней, их нроводимость и вероятнос

3.2.3 Селективность канаюв пептаиболов Каналы нептаиболов и их производных, как положительно, так и отрицательно заряже1П1ых, демонстрируют слабую катионную селективность [64], косвенно подтверждая роль экспонированных карбонильных групп в центре снирали в проведении ионов сквозь канал [21,80,118]. Исследования на макросконическом уровне [276] показали, что каналы Alm-RBO различают различные типы одновалентных катионов, двухвалентные катионы и анионы. Для нроницаемости различных ионов были

3.2.4 Kanaibi пептаиболов в везикулах и целых клетках (6) Зерваминин (16-остатков) и аламетицин (20-остатков) в везикулярных системах также демонстрируют увеличение проницаемости мембраны для различных ионов. Каналы, образованные этими нептидами, как и в плоских мембранах, активируются cisположительными значениями потенциала [24,243,246]. Однако, при больших концентрациях пептидов наблюдается и потенциал-независимая нроводимость [24,246], которая инактивируется нри наложении с/5-отрицательн

4.1.1 Исследование структуры Zrv-ilB в органических растворителях. Приготовление образцов, ЯМР-спектроскопия и отнесение сигналов. Для экспериментов в органических растворителях 12 мг Zrv-IIB (молекулярный вес 1838

Да) растворялось в

0.6 мл или CD3OH, или в смесях CDCI3/CD3OH с объемной концентрацией CDCI3 от 10% до 90%, или в смесях CD3OH/H2O с объемной концентрацией ПгО от 5% до 50%. В работе использовались дейтерированный метанол (

99.5% дейтерия, Stohler Isotope Chem

4.1.2 Расчет пространственной структуры и энергетическая минимизация. по данным ЯМР был осуществлен в Расчет пространственной структуры нрофамме DYANA [318], используя метод молекулярной динамики в пространстве торсионных углов и алгоритм "моделируемого отжига" (simulated annealing). Для уменьщения эффекта спиповой диффузии интенсивности кросс-пиков ЯЭО измерялись в спектре NOESY с Т 200 мс с помощью программы XEASY посредством интегрирования щ но эллинтической области. Ограничен

4.2.2 Исследование взаимодействия пептида с растворителем и прямое наблюдение системы водородных связей. Температурные коэффициенты для СОи HN-rpynn были измерены из набора HNCO [323] и HN(CA)CO [324] спектров накопленных в диапазоне температур 10-50°С. Определение системы водородных связей и измерение JNC ( К С С В через водородные связи) было выполнено иснользуя дальний 2D HNCO эксперимент при двух температурах 32 и 42'^С [182]. Дальний 2D HNCO эксперимент и сравнительный 2D HNCO

4.2.3 Уточнение пространственной структуры Zrv-IIB в метаноле. Нространственная структура Zrv-IIB была рассчитана по алгоритму, изложенному в пункте

4.1.2, с теми же ограничениями на углы и расстояния. Водородные связи, напрямую наблюдаемые в дальнем HNCO спектре, были ограничены аналогичным способом. Для выяспения типа водородной связи с HN-группы Aib'^ было проведено три структурных расчета в программе DYANA (Рис. 10, колонки Zrvl, ZrvII, ZrvIII) в которых эта водородная связь была

4.3.1 Исследование спин-меченых аналогов зервамицина в метаноле. Приготовление образцов и ЯМР-спектроскопия. Пептиды были растворепы в

0.15 мл CD3OH в различных концентрациях: Zrv-IIB в диапазоне

0.1 —

18.1 мМ; Zrv-T16 — в диапазоне

0.05 —

3.5 мМ; Zrv-TO — в единственной концентрации

0.5 мМ. рН растворов составлял

5.7 (не корректированные показания рНметра). Спектры ЯМР были получены на спектрометре Вшкег DRX-500 при температуре 30°С, используя тол

4.3.2 Измерение расстояний: протон - спиновая метка. Факторы внутримолекулярного усиления релаксации (/?!" и Лг") были вычислены как разница между скоростями релаксации в снин-меченых нентидах и Zrv-IIB. Для выявления эффекта межмолекулярного усиления релаксации, скорости релаксации R\ к R2 были линейно экстрацолированы на нулевую концентрацию неитидов (Рис 16). Скорости релаксации для нентида Zrv-TO были измерены нри одной концентрации (

0.5 мМ), при которой межмолекулярны

4.4.1 Исследование структуры Zrv-IIB в растворе DPC мицелл. Приготовление образцов, ЯМР-спектроскопия и отнесение сигнаюв. Для проведения экспериментов в мицеллярном окружении был нриготовлен раствор, содержащий

1.8 мМ Zrv-IIB и 71 мМ дейтерированного додецилфосфохолина (DPC) (98% дейтерия, Avanti Polar Lipids, USA). Соотношение пептид:детергент (P:D) было равно 1:40. Образцы были растворены в

0.6 мл НгО (10% D2O). Поскольку Zrv-IIB водонерастворим, предполагалось, что весь пеп

4.4.2 Расчет пространственной структуры и определение положения пептида относительно поверхности мицеллы. Расчет пространственной структуры по данным ЯМР был осуществлен по схеме изложенной в нупкте

4.1.2. со следующими отличиями. Интенсивности кросс-пиков ЯЭО измерялись в спектре NOESY с Т 100 мс. Образующими водородные связи считались те щ протоны, чье время полуобмепа на дейтерий растворителя было больще или равно 2 часам. Для исследования положения пептида относительно поверхпост

4.5 Подготовка рисунков, депонирование экспериментальных данных и полученных структур. Визуальный анализ полученных структур (определепие длины молекулы, и угла изгиба спирали) и подготовка рисунков, как в литературном обзоре, так и в эксперимептальной части этой диссертационной работы, вынолнялись с использованием программы MOLMOL [335]. Угол изгиба спирали на остатке Pro/Hyp(i) вычислялся как угол между осями цилиндров, включающих в себя атомы основной цепи остатков (от 1 до i-1) и (от

5.2.1 Исследование 15 С-^N-меченого Zrv-IIB в метаноле. ЯМР-характеризация ^^C-'^N-меченого Zrv-IIB, определение степени включения изотопных меток и отнесение метильных групп остатков Aib. Полное отнесение '^С и '^N сигналов пептида было осуществлено, используя полученное ранее отнесение 'Н сигналов. Наличие одного набора сигналов в спектрах )тсазывало на отсутствие примесей, а гомоядерные и гетероядерные эксперименты позволили установить степень включения изотопов в пептид. Степень в

5.2.2 Прямое наблюдение системы водородных связей в '^С-'^М-меченом Zrv-IIB в метаноле. В обычном ЯМР исследовании выводы о роли отдельных HN-грунн в качестве допоров водородных связей в нентиде, обычно делаются на основании скоростей обмена амидных протонов на дейтерий растворителя [317] или их температурных градиентов [340]. Акцепторы водородпых связей вьщеляются, либо используя предварительпо рассчитанную структуру биомолекулы, либо на осповапии характерпых коптактов ЯЭО. Во мпогих случ

5.2.3 Сила водородных связей в cnupaiu Zrv-IIB, связь с динамическим поведением пептида. Величина КССВ через водородную связь зависит от длины связи [341] и от других геометрических параметров [343,344], папример, средняя велпчипа ""'JNC В р-структурах белков (где водородпые связи обычно короче, в среднем на

0.1 А [342]) равна -

0.65 Гц, а в а-спиралях (где водородные связи длиннее [342]) равна -

0.38 Гц. Кроме того, величины ^''JNC значительно зависят от динамики

5.2.4 Уточнение структуры Zrv-IIB в метаноле. Расчет структуры пептида был повторен, иснользуя ограничения на наблюдаемые в эксперименте водородные связи. Для выяснения типа бифуркационной водородной связи (HN Aib'^ СО Leu^, Aib') (переключение между акцепторами, или две связи одповременно) было проведено три цикла расчета структуры в программе DYANA с последующей энергетической минимизацией в программе FANTOM, используя силовое поле ЕСЕРР/2. В этих циклах водородная связь с HN Aib'^ была

5.2.5 Взаимодействие HN- и СО-групп основной цепи Zrv-IIB с растворителем. экспериментально измеренную систему водородных связей в Используя зервамипине в метаноле, мы можем указать на все не участвующие в образовании водородных связей HN- и СО-группы (они показаны на Рисуике 13 треугольниками и звездочками, соответственно). Как видно из рисупка, С-копец молекулы более поляреп, чем N-конец (4 свободных СО-группы, против 3 свободных HN-rpynn), что объясняет ассиметрию вольт амперной характер

5.3.1 Исследование спин-меченых аналогов зервамицина в метаноле. Меэ1амо.1екулярные взаимодействия в Zrv-IIB и спин-мечепых аналогах. Рис. 16. Зависимость от концентрации Zrv-T16cKopocTH релаксации Ri для протонов HN Т ф ' (нижняя кривая) и Н^' Т ф ' (верхняя кривая). Точки в диапазоне концентраций

0.05 -

1.6 мМ линейно аппроксимированы. Этот рисунок иллюстрирует влияние межмолекулярного парамагнитного усиления релаксации на скорости релаксации в спин-меченых пептидах.

0.5<

5.3.2 Измерение расстояний: протон — спиновая метка в спин-меченых аналогах Zrv-IIB. Парамагнитное усиление релаксации в спин-меченых аналогах зервамицина позволило измерить средние расстояния между HN-нротонами основной цепи и спиновыми метками, находящимися на N- или С-конце молекул пептидов. Полученные данные и согласование их со структурой Zrv-IIB в метаноле ноказаны на Рис. 17. Эти расстояния усреднены как (<г^>"^), следовательно, они ближе к расстояниям наибольшего сближения

5.4 Исследование структуры Zrv-IIB в растворе DPC мицелл. Исследование зервамицина в изотропных средах неполярных растворителей позволило детально охарактеризовать его структуру и динамику. Однако эти растворы лишь частично моделируют свойства мембраны, их объединяет с мембраной только гидрофобность, близкая к таковой у углеводородного региона бислоя. Бислойные мембраны анизотропны, они имеют как гидрофобную часть, так и окружающие ее полярные области. Это свойство мембран очень важно для

5.4.1 Стехиометрия комплекса Zrv-IIB/DPC мицелла. Формирование комнлекса между Zrv-IIB и DPC наблюдали, измеряя коэффициент трансляционной диффузии мицелл DPC, в растворе без нентида, и измеряя коэффициент трансляционной диффузии Zrv-IIB, в растворе, содержащем как нентид, так и детергент. Коэффициент диффузии мицеллы DPC равен

1.20±

0.02 х10*'° м^/с, что соответствует радиусу Стокса

23.1±

0.5 А. В то же время коэффициент диффузии зервамицина в присутствии DPC (отно

5.4.2 Структура Zrv-IIB в растворе DPC мицелл. Структура пептида была рассчитапа, используя схему, примепявщуюся для расчета структуры в метаноле. Сводка данных ЯМР представлена на Рисунке 11Б, а структурная статистика и полученная структура на Рисунке 10 (колонка ZrvM). Молекула представляет собой амфифильную нравозакрученную спираль, изогнутую на Нур'° под углом ~ 20*^. Спираль пептида имеет длину ~26 А. По этим и другим параметрам структура очень близка к уточнен1юй структуре Zrv-IIB в м

5.4.3 Положение молекулы Zrv-IIB относительно поверхности мицеллы. 5-доксилстеариновой кислоты и 16-доксил стеариновой кислоты Молекулы встраиваются в мицеллу таким образом, что их спиновые метки располагаются в положениях близких к поверхности мицеллы и ее центру, соответственно. Вызываемая этими метками парамагнитная релаксация мицеллосвязанных пептидов, значительно уширяет сигналы и, соответственно, уменьшает их интенсивность. Это позволяет определить способ связывания пептида с мицеллой

5.5 Модель действия Zrv-IIB. потенциала и потенциала молекулярной Распределение электростатического гидрофобности на поверхности мономера Zrv-IIB показаны на рис. 19. Как видно, молекула представляет собой амфифильную спираль с большим полярным участком на выпуклой стороне спирали и полностью гидрофобна с вогнутой стороны. Полярность Сконца молекулы дополнительно усилена экспонированными карбонилами остатков Aib^, Aib', Нур'*^, Aib''* и Pro'^, полярными боковыми группами Hyp'*', Gin"

5.5.1 Потенциаи-зависичая активация каначов зервамицина. В рамках модели «ре-ориентапии-встраивания потенпиал-зависимая активапия пептида связана с реориентапией жесткого снирального диполя из поверхностно связанного состояния в ТМ состояние и переноса N-копца молекулы через мембрапу. Большие структурные перестройки в молекуле нептида и измепепие угла изгиба спирали в ходе этого пропесса Нростые представляются расчеты маловероятными согласие из-за жесткости снирали и зервамицина. ноказыв

5.5.2 Ассиметрия волътамперной характеристики Zrv-IIB. Ассиметрия вольтамиерной характеристики пептида может быть объяснена из относительной полярности С-концевой части молекулы (рис. 19). Видимо, экспонированные карбонильные группы, и полярные боковые цени в этой части молекулы формируют множественные водородные связи с головками липидов, создавая тем самым своеобразный якорь на поверхпости мембраны. Это позволяет пропикать пептиду в глубь бислоя только N-концевой частью, что соответствуе

5.5.3 Потенциал-иезависгглюе поведение Zrv-IIB. Потенциал-независимое поведение Zrv-IIB, наблюдаемое в везикулярных системах при больших отношениях пептид-липид (P:L) [24,25], может бьггь объяснено из статистических и энергетических соображений. Активация внешним трансмембранным нотенциалом в 100 мВ (типичное значение для активации каналов зервамицина) нриводит к дополнительной стабилизации ТМ состояния на

0.8 кКал/Моль (мембрана толщихюй 30 А, ^D ~ 50 D), что сравнимо с характерной э

5.5.4 Структура каначов зервамиципа. Взаимодействия N-конец к С-концу между спиралями зервамиципа, наблюдаемые при больших концентрациях в метаноле, модулируются дииольпым моментом спиралей пептида и, вероятно, не имеют отношения к афегации ТМ мономеров пептида в мембране в процессе формирования каналов. Ассиметрия вольтамперной характеристики указывает на то, что пептиды в связке должны быть ориентированы параллельно. Хотя в этом случае отталкивание спиральных диполей должно дестабилизиро

5.5.5 Селективность каналов зервамицина. В отличии от длинных пептаиболов Zrv-IIB взаимодействует с растворителем большой полярной областью, сформированной из полярных боковых цеией и экспонированных СО-фунп основной цепи, и эти грзшпы ио отдельности не формируют сайтов сильной гидратации. Возможно, именно увеличенный 98 (по сравнению с аламетицином) полярный регион на поверхности спирали Zrv-IIB и другой тип взаимодействия нентид/растворитель приводят к изменению селективности каналов это